En 1357 fue sitiado por las tropas castellanas. En el siglo XV pese a la paz con los castellanos, no cesaron las luchas en la comarca ya que los Liñán, señores de Cetina se enfrentaron a los Fernández de Heredia, señores de Sisamón. Jerónimo Zurita registra un duelo que requiere la intervención regia en 1452 entre el señor de Sisamón, Juan Fernández de Heredia y el de Cetina, Alfonso de Liñán.^[]​ Los conflictos armados nobiliarios mantuvieron el uso militar del castillo hasta la boda el 10 de marzo de 1509 de Juan Fernández de Heredia, señor de Sisamón, con Jerónima de Liñan, hija y heredera del señor de Cetina y Contamina Miguel de Liñán. Dicho matrimonio causó la unión de ambas casas, pacificó la comarca y sentó las bases del futuro condado de Contamina.