La torre se menciona desde 1435, y el señorío de Arrayoz, desde 1445. A comienzos del s. XVI pertenecía a Martín de Ursúa, aliado de Fernando de Aragón en la anexión de Navarra. Estuvo en la conquista del castillo de Amayur, acción por la que fue recompensado con la puerta blindada de la fortaleza, que se conserva en la torre como trofeo.
En 1612 se usó como prisión para unas mujeres acusadas de brujería, en relación con el famoso proceso de Zugarramurdi que concluyó con un auto de fe en Logroño (1612)
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